「武器」×「職人」の連携プレイで敵をなぎ倒す「タッチペン共鳴アクション」！！
アニメ第1話～第24話「魔女・メデューサの陰謀」＋IFシナリオが体験できます。
十字キーで「職人」を、タッチペンで「武器」を操る直感操作が楽しい「タッチペン共鳴アクション」3組の主人公達を状況に応じて使い分ける「キャラクターチェンジシステム」 状況、敵の相性に応じて、各キャラを使い分けることでバトルを有利に進めることが出来ます。
戦い方によって魂の波長が変化！
会話も変化する！
波長が合うほど、息の合う会話が発生！
波長が合わないと、喧嘩ばかり・・・。
「魂の共鳴ゲージ」をためて出す必殺技！
ソウルイーターらしい迫力のバトルが体験できます。
魂が中心に達すると「魂の共鳴」状態！
「共鳴アイコン」タッチで「魂の共鳴」モードに！
さらに、「魂の共鳴」×「キャラクターチェンジ」で必殺コンボ「共鳴連携」も可能！
ゲーム中、大人気「ソウルイーター フレイズコレクション」カードを収集するコレクション要素もあります。
80種類以上の美麗なフレイズカードを収録！
さまざまな条件でカードが収集できる！