「DS劇ケロ3」の“横スク”システムを踏襲した完全新作！！
ケロロ軍曹色200％UP！？
我輩たちのパワーはここまで進化したっ！！
「フリー侵略システム」で己の道は自分で切り開くであります！
「DS劇ケロ3」では、完全一本道だったステージ進行が自分で進みたいルートを選んでいくシステムに変更！
苦手なステージを後回しにすることも可能！
最終的にはステージ侵略率100％を目指すであります！
ついに地球人も参戦！？
「DS劇ケロ3」では、イベントシーンのみに登場した地球人たちが小隊メンバーを助けるサポートキャラに！
スペシャルゲーム＆コレクションももちろん進化！
過去のゲームをオマージュしたボス戦は今作も健在！
懐か新しい！
100体以上のキャラを集められるか！？
コレクター心をくすぐるケロン星人型宇宙人大百科！
本ゲームのためオリジナルキャラクターが登場！！
映画本編にも登場しない、原作者「吉崎観音先生」描き下ろしのオリジナルキャラクターが登場！
「ドララ」と名づけられたこのキャラがゲームストーリーに絡むことにより映画とはまた異なった楽しみをゲームユーザーに与える！