主人公、源 九朗は風邪で学校を休んでしまい、学校につくと美化委員長にさせられていることを知ります。
委員長に任命されてしまったことから先生の目が向くようになり、放課後は居残り掃除をすることになります。
掃除をしているとお掃除を司る精霊まりーと出会い、何者かが、まりーたちお掃除精霊と対極にある、汚れ魔王の力で学校を汚そうと企んでいることを知ります。
それを阻止するには、お掃除精霊とそれを見ることができる女の子をお互いに信頼できるようにし、お掃除戦士を誕生させなければなりません。
主人公は、精霊と女の子がお互いに信頼できるようにあれこれ手を尽くします。
果たして主人公は精霊と女の子を仲良くさせることができるのでしょうか？
そして汚れ魔王の力を退ける戦士を揃えることができるのでしょうか？